HNRNPK - HNRNPK

HNRNPK
Proteína HNRPK PDB 1j5k.png
Estructuras disponibles
PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
Alias HNRNPK , CSBP, HNRPK, TUNP, AUKS, ribonucleoproteína nuclear heterogénea K
Identificaciones externas OMIM : 600712 MGI : 99894 HomoloGene : 81909 GeneCards : HNRNPK
Ortólogos
Especies Humano Ratón
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (ARNm)
RefSeq (proteína)
Ubicación (UCSC) Crónicas 9: 83,97 - 83,98 Mb Crónicas 13: 58,39 - 58,4 Mb
Búsqueda en PubMed
Wikidata
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La ribonucleoproteína nuclear heterogénea K (también proteína K ) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen HNRNPK . Se encuentra en el núcleo celular que se une al ARN pre- mensajero (ARNm) como un componente de partículas de ribonucleoproteína heterogéneas . El homólogo de simio se conoce como proteína H16 . Ambas proteínas se unen tanto al ADN monocatenario como al ARN y pueden estimular la actividad de la ARN polimerasa II , la proteína responsable de la mayor parte de la transcripción de genes . Las afinidades relativas de las proteínas por el ADN y el ARN varían con las condiciones de la solución y están inversamente correlacionadas, de modo que las condiciones que promueven una fuerte unión al ADN dan como resultado una unión débil del ARN.

Los dominios de proteínas de unión a ARN en otras proteínas que son similares al dominio de unión de ARN de la proteína K se denominan dominios de homología K o dominios KH .

La proteína K ha sido objeto de un estudio relacionado con el cáncer colorrectal , en el que se descubrió que un evento de edición de ARN que induce la expresión de una isoforma que contiene una mutación puntual es específico de las células cancerosas.

Función

Este gen pertenece a la subfamilia de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas expresadas de forma ubicua (hnRNP). Los hnRNP son proteínas de unión a ARN y forman complejos con ARN nuclear heterogéneo (hnRNA). Estas proteínas están asociadas con pre-mRNA en el núcleo y parecen influir en el procesamiento del pre-mRNA y otros aspectos del metabolismo y transporte del mRNA . Si bien todos los hnRNP están presentes en el núcleo, algunos parecen desplazarse entre el núcleo y el citoplasma.

Las proteínas hnRNP tienen distintas propiedades de unión a ácidos nucleicos. La proteína codificada por este gen se encuentra en el nucleoplasma y tiene tres repeticiones de dominios KH que se unen a los ARN. Se diferencia de otras proteínas hnRNP en su preferencia de unión; se une tenazmente a poli (C). También se cree que esta proteína tiene un papel durante la progresión del ciclo celular. Se han descrito múltiples variantes de transcripción empalmadas alternativamente para este gen, pero solo se han descrito completamente tres variantes.

Las mutaciones en ambas copias de HNRNPK son letales para el embrión en ratones. Los ratones con ambas copias del gen anuladas mueren antes del día 14 de desarrollo embrionario .

Significación clínica

Síndrome de Okamoto

Las mutaciones en HNRNPK causan el síndrome de Okamoto , también conocido como síndrome de Au-Kline.

Cánceres de sangre

Se han encontrado deleciones en la región que abarca HNRNPK en las células de leucemia mieloide aguda en aproximadamente el 2% de los casos. Además, la mayoría de los ratones a los que se les ha eliminado artificialmente uno de sus genes HNRNPK desarrollaron cánceres mieloides , con un tercio en desarrollo de cánceres linfoides y un 4% en desarrollo de carcinomas hepatocelulares . Los ratones también eran más pequeños, tenían órganos menos desarrollados y tenían una mayor mortalidad posnatal (30%). La esperanza de vida media de los ratones que sobrevivieron fue inferior al 50% de la de los ratones de tipo salvaje. Las deficiencias en HNRNPK parecen reducir específicamente los niveles de la isoforma p42 de CEBPA , que es un factor de transcripción involucrado en la diferenciación de ciertas células sanguíneas , así como p21 (inhibidor de quinasa dependiente de ciclina 1), que está involucrado en pausar el desarrollo celular. para la reparación del ADN .

La sobreexpresión de HNRNPK también parece contribuir a los cánceres a través de un mecanismo diferente que implica la traducción en lugar de la transcripción .

Interacciones

Se ha demostrado que HNRPK interactúa con:

Proteínas humanas que contienen un dominio KH

AKAP1 ; ANKHD1 ; ANKRD17 ; ASCC1 ; BICC1 ; DDX43 ; DDX53 ; DPPA5 ; FMR1 ; FUBP1 ; FUBP3 ; FXR1 ; FXR2 ; HDLBP ; HNRPK ; IGF2BP1 ; IGF2BP2 ; IGF2BP3 ; KHDRBS1 ; KHDRBS2 ; KHDRBS3 ; KHSRP ; KRR1 ; MEX3A ; MEX3B ; MEX3C ; MEX3D ; NOVA1 ; NOVA2 ; PCBP1 ; PCBP2 ; PCBP3 ; PCBP4 ; PNO1 ; PNPT1 ; QKI ; SF1 ; TDRKH ;

Referencias

Otras lecturas

enlaces externos

  • Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P61978 (ribonucleoproteína nuclear heterogénea humana K (HNRPK)) en el PDBe-KB .