Informática del genoma del ratón - Mouse Genome Informatics
Mouse Genome Informatics ( MGI ) es una base de datos en línea gratuita y un recurso bioinformático alojado por The Jackson Laboratory , con fondos del National Human Genome Research Institute (NHGRI), el National Cancer Institute (NCI) y el Eunice Kennedy Shriver National Institute of Salud infantil y desarrollo humano (NICHD). MGI proporciona acceso a datos sobre genética, genómica y biología del ratón de laboratorio para facilitar el estudio de la salud y las enfermedades humanas. La base de datos integra múltiples proyectos, con las dos contribuciones más grandes provenientes de Mouse Genome Database y Mouse Gene Expression Database (GXD). A partir de 2018, MGI contiene datos seleccionados de más de 230.000 publicaciones.
El recurso MGI se publicó por primera vez en línea en 1994 y es una colección de datos, herramientas y análisis creados y adaptados para su uso en el ratón de laboratorio , un organismo modelo ampliamente utilizado . Es "la fuente autorizada de nombres oficiales para genes, alelos y cepas de ratón", que siguen las pautas establecidas por el Comité Internacional de Nomenclatura Genética Estandarizada para Ratones. La historia y el enfoque de las instalaciones de investigación y producción del Laboratorio Jackson generan un conocimiento y una profundidad tremendos que los investigadores pueden extraer para avanzar en su investigación. Una comunidad dedicada de investigadores de ratones, en todo el mundo, también mejora y contribuye al conocimiento. Esta es una herramienta indispensable para cualquier investigador que utilice el ratón como organismo modelo para su investigación y para los investigadores interesados en genes que comparten homología con los genes del ratón. Varios recursos de apoyo a la investigación de ratones, incluidas colecciones de animales y software gratuito de gestión de colonias, también están disponibles en el sitio de MGI.
Base de datos del genoma del ratón
Contenido | |
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Descripción | recurso para la genómica y genética de mamíferos. |
Contacto | |
Centro de Investigación | Laboratorio Jackson |
Cita primaria | Judith Blake y otros (2011) |
Acceso | |
Sitio web | http://www.informatics.jax.org |
URL de descarga | ftp://ftp.informatics.jax.org/ |
La base de datos del genoma del ratón recopila y selecciona anotaciones funcionales y fenotípicas completas para genes y alelos de ratón . Este es un proyecto financiado por NHGRI que contribuye a la base de datos de Mouse Genome Informatics.
Base de datos de expresión génica de ratón
Contenido | |
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Descripción | La base de datos de expresión génica del ratón |
Organismos | Mus musculus |
Contacto | |
Centro de Investigación | El laboratorio de Jackson |
Cita primaria | Finger & al. (2011) |
Fecha de lanzamiento | 1996 |
Acceso | |
Sitio web | http://www.informatics.jax.org/expression.shtml |
La Base de datos de expresión genética es un recurso comunitario de información sobre la expresión del desarrollo del ratón.
Ver también
- Flybase
- Base de datos del genoma de ratas
- Base de datos del genoma de Saccharomyces
- Wormbase
- Xenbase
- Red de información del pez cebra
Referencias
enlaces externos
- Bult, Carol J .; Blake, Judith A .; Smith, Cynthia L .; Kadin, James A .; Richardson, Joel E .; Grupo de base de datos del genoma del ratón (08/01/2019). "Base de datos del genoma del ratón (MGD) 2019" . Investigación de ácidos nucleicos . 47 (D1): D801 – D806. doi : 10.1093 / nar / gky1056 . ISSN 1362-4962 . PMC 6323923 . PMID 30407599 .
- Página de inicio de Mouse Genome Informatics
- Smith, Constance M .; Hayamizu, Terry F .; Dedo, Jacqueline H .; Bello, Susan M .; McCright, Ingeborg J .; Xu, Jingxia; Baldarelli, Richard M .; Beal, Jonathan S .; Campbell, Jeffrey; Corbani, Lori E .; Frost, Pete J. (8 de enero de 2019). "La base de datos de expresión génica del ratón (GXD): actualización de 2019" . Investigación de ácidos nucleicos . 47 (D1): D774 – D779. doi : 10.1093 / nar / gky922 . ISSN 1362-4962 . PMC 6324054 . PMID 30335138 .
- Publicaciones de informática del genoma del ratón
- Tutorial del taller Open Door
- Base de datos de Gene eXpression (GXD)