SETDB1 - SETDB1
La histona-lisina N-metiltransferasa SETDB1 es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen SETDB1 . SETDB1 también se conoce como KMT1E o H3K9 metiltransferasa ESET.
Función
El dominio SET es un motivo altamente conservado de aproximadamente 150 aminoácidos implicado en la modulación de la estructura de la cromatina . Originalmente se identificó como parte de una región conservada más grande presente en la proteína Drosophila Trithorax y posteriormente se identificó en las proteínas Drosophila Su (var) 3-9 y 'Enhancer of zeste', de las que se deriva el acrónimo SET. Los estudios han sugerido que el dominio SET puede ser una firma de proteínas que modulan estados de cromatina transcripcionalmente activos o reprimidos a través de actividades de remodelación de cromatina.
Organismos modelo
| Característica | Fenotipo |
|---|---|
| Viabilidad homocigota | Anormal |
| Estudio letal recesivo | Anormal |
| Fertilidad homocigota | Normal |
| Peso corporal | Normal |
| Ansiedad | Normal |
| Evaluación neurológica | Normal |
| La fuerza de prensión | Normal |
| Plato caliente | Normal |
| Dismorfología | Normal |
| Calorimetría indirecta | Normal |
| Prueba de tolerancia a la glucosa | Normal |
| Respuesta auditiva del tronco encefálico | Normal |
| DEXA | Normal |
| Radiografía | Normal |
| Temperatura corporal | Normal |
| Morfología ocular | Normal |
| Química Clínica | Normal |
| Hematología | Normal |
| Linfocitos de sangre periférica | Anormal |
| Prueba de micronúcleos | Normal |
| Peso del corazón | Normal |
| Epidermis de la cola Wholemount | Normal |
| Histopatología de la piel | Normal |
| Histopatología cerebral | Normal |
| MicroCT y faxitrón cuantitativo | Anormal |
| Infección por Salmonella | Normal |
| Infección por Citrobacter | Normal |
| Todas las pruebas y análisis de |
Se han utilizado organismos modelo en el estudio de la función SETDB1. Una línea de ratones knockout condicional , llamada Setdb1 tm1a (EUCOMM) Wtsi, se generó como parte del programa International Knockout Mouse Consortium , un proyecto de mutagénesis de alto rendimiento para generar y distribuir modelos animales de enfermedades a los científicos interesados.
Los animales machos y hembras se sometieron a un cribado fenotípico estandarizado para determinar los efectos de la deleción. Se llevaron a cabo veintisiete pruebas en ratones mutantes y se observaron cuatro anomalías significativas. No se identificaron embriones mutantes homocigotos durante la gestación y, por lo tanto, ninguno sobrevivió hasta el destete . Las pruebas restantes se llevaron a cabo en ratones adultos mutantes heterocigotos y se observaron dos anomalías significativas. Las hembras tenían datos anormales de linfocitos de sangre periférica y ambos sexos mostraron una mayor fuerza ósea y contenido mineral.
El pez cebra es un organismo modelo importante para estudiar la biología del desarrollo y se ha utilizado para estudiar la genética del cáncer. Una pantalla para identificar nuevos oncogenes en el melanoma realizada en pez cebra identificó a SETDB1 como un oncogén que coopera con otro gen del cáncer, BRAF, para acelerar la aparición del melanoma. Informes posteriores han relacionado SETDB1 con el carcinoma hepatocelular
Interacciones
Se ha demostrado que SETDB1 interactúa con TRIM28 .>
Referencias
Otras lecturas
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enlaces externos
- FactorBook SETDB1
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q15047 (Histona-lisina N-metiltransferasa SETDB1) en el PDBe-KB .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .