NeuroNames - NeuroNames

NeuroNames
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Contenido
Descripción Nomenclatura jerárquica integral para las estructuras del cerebro de los primates (humanos y macacos)
Tipos de datos
capturados
Neuroanatomía
Acceso
Sitio web http://braininfo.rprc.washington.edu/
Diverso
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NeuroNames es una nomenclatura integrada para las estructuras del cerebro y la médula espinal de las cuatro especies más estudiadas por los neurocientíficos: humano , macaco , rata y ratón . Ofrece un vocabulario estándar y controlado de nombres comunes para estructuras, que es adecuado para la indexación neuroanatómica inequívoca de información en bases de datos digitales. Los términos del vocabulario estándar se han seleccionado por su facilidad de pronunciación, valor mnemónico y frecuencia de uso en publicaciones neurocientíficas recientes. Las estructuras y sus relaciones entre sí se definen en términos del vocabulario estándar. Actualmente, NeuroNames contiene nombres estándar, sinónimos y definiciones de unas 2.500 entidades neuroanatómicas.

La nomenclatura la mantiene la Universidad de Washington y es el componente principal de una herramienta llamada "BrainInfo". BrainInfo ayuda a identificar las estructuras del cerebro. Uno puede buscar por el nombre de una estructura o ubicar la estructura en un atlas cerebral y obtener información como su ubicación en la jerarquía cerebral clásica, imágenes de la estructura, qué células tiene, sus conexiones y genes expresados ​​allí. Se puede acceder a la información mediante cualquiera de los 16.000 sinónimos en ocho idiomas.

NeuroNames es un vocabulario fuente del Metathesaurus del Unified Medical Language System . Se describe en profundidad en los siguientes tres artículos científicos :

  • DM Bowden y RF Martin (marzo de 1995). "Jerarquía del cerebro de NeuroNames". NeuroImage . 2 (1): 63–83. doi : 10.1006 / nimg.1995.1009 . PMID   9410576 . S2CID   24847350 .
  • DM Bowden y MF Dubach (2003). "NeuroNames 2002". Neuroinformática . 1 (1): 43–59. doi : 10.1385 / NI: 1: 1: 043 . PMID   15055392 . S2CID   12575028 .
  • DM Bowden; E. Song; J. Kosheleva; MF Dubach (2011). "NeuroNames: una ontología para el portal BrainInfo a la neurociencia en la Web" . Neuroinformática . 10 (1): 97-114. doi : 10.1007 / s12021-011-9128-8 . PMC   3247656 . PMID   21789500 .

Ver también

enlaces externos