LIG4 - LIG4

LIG4
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Lista de códigos de identificación de PDB
	1IK9 , 2E2W , 3II6 , 3VNN , 3W1B , 3W1G , 3W5O , 4HTO , 4HTP
Identificadores
Alias	LIG4 , LIG4S, ADN ligasa 4
Identificaciones externas	OMIM : 601837 MGI : 1335098 HomoloGene : 1736 GeneCards : LIG4
Ubicación de genes ( humanos )
Chr.	Cromosoma 13 (humano)
Fin	108,218,368 pb
Ubicación de genes ( ratón )
Chr.	Cromosoma 8 (ratón)
Fin	9,977,686 pb
Patrón de expresión de ARN
	Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes
Función molecular	• de nucleótidos de unión ; • unión de iones metálicos ; • proteína C-terminal de unión ; • GO: proteína de unión 0001948 ; • unión a ATP ; • ADN ligasa (ATP) la actividad ; • actividad ligasa ; • unión a ADN ; • DNA ligasa actividad;
Componente celular	• nucleoplasma ; • ligasa IV de ADN complejo ; • recombinación no homóloga complejo ; • cromosoma condensado ; • núcleo ; • proteína dependiente de ADN quinasa ADN ligasa 4 complejo ; • citoplasma ; • citoplasmática ribonucleoprotein gránulo;
Proceso biológico	• Reparación por escisión de nucleótidos, relleno de huecos de ADN ; • Reparación de rotura de doble hebra mediante unión de extremos no homóloga clásica ; • Respuesta a la radiación ionizante ; • Recombinación de ADN ; • Elongación de hebra retrasada ; • Proceso biosintético del ADN ; • Respuesta celular al ion litio ; • Reparación de rotura de hebra simple ; • Respuesta celular al estímulo daño en el ADN ; • división celular ; • la replicación del ADN ; • GO: 1903310 regulación positiva de la organización de los cromosomas ; • establecimiento de integrado proviral latencia ; • ciclo celular ; • respuesta a los rayos X ; • regulación positiva de la neurogénesis ; • ligadura de ADN implicada en la recombinación de ADN ; • ligación de ADN ; • Ligadura de ADN involucrada en la reparación del ADN ; • Mantenimiento de la población de células madre somáticas ; • Organización de los cromosomas ; • Recombinación del receptor de células T V (D) J ; • Proceso apoptótico de neuronas ; • Cambio de isotipo ; • Diferenciación de células T en el timo ; • Desarrollo del sistema nervioso central ; • Inmunoglobulina V (D) J recombinación ; • reparación de rotura de doble hebra mediante unión de extremos no homólogos ; • regulación positiva de fibroblastos pr oliferación ; • desarrollo embrionario en el útero ; • proliferación de la población celular ; • recombinación V (D) J ; • diferenciación de células pro-B ; • reparación del ADN ; • respuesta a la radiación gamma ; • reparación de rotura de doble hebra ; • regulación negativa del proceso apoptótico neuronal ; • respuesta celular a la radiación ionizante;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	3981
	319583
	ENSG00000174405
	ENSMUSG00000049717
	P49917
	Q8BTF7
NM_001098268 ; NM_002312 ; NM_206937 ; NM_001330595 ; NM_001352598;
	NM_001352599 ; NM_001352600 ; NM_001352601 ; NM_001352602 ; NM_001352603 ; NM_001352604 ; NM_001379095
	NM_176953 ; NM_001377042
NP_001091738 ; NP_001317524 ; NP_002303 ; NP_996820 ; NP_001339527;
	NP_001339528 ; NP_001339529 ; NP_001339530 ; NP_001339531 ; NP_001339532 ; NP_001339533 ; NP_001366024
	NP_795927 ; NP_001363971
	Wikidata
Ver / editar humano	Ver / Editar mouse

La ADN ligasa 4 es una enzima que en humanos está codificada por el gen LIG4 .

Función

La proteína codificada por este gen es una ADN ligasa dependiente de ATP que se une a las roturas de doble hebra durante la vía de unión de extremos no homólogos de reparación de rotura de doble hebra. También es esencial para V (D) J recombinación . Lig4 forma un complejo con XRCC4 y además interactúa con la proteína quinasa dependiente de ADN (ADN-PK) y XLF / Cernunnos , que también son necesarios para NHEJ. Se ha resuelto la estructura cristalina del complejo Lig4 / XRCC4. Los defectos en este gen son la causa del síndrome LIG4 . El homólogo de levadura de Lig4 es Dnl4.

Síndrome LIG4

En los seres humanos, la deficiencia de ADN ligasa 4 da como resultado una afección clínica conocida como síndrome LIG4. Este síndrome se caracteriza por sensibilidad a la radiación celular, retraso del crecimiento, retraso del desarrollo, microcefalia, dismorfismos faciales, mayor predisposición a la leucemia, grados variables de inmunodeficiencia y número reducido de células sanguíneas.

Envejecimiento de las células madre hematopoyéticas

La acumulación de daño en el ADN que conduce al agotamiento de las células madre se considera un aspecto importante del envejecimiento. La deficiencia de lig4 en las células madre pluripotentes altera la unión de extremos no homólogos (NHEJ) y da como resultado la acumulación de roturas de doble hebra del ADN y un aumento de la apoptosis. La deficiencia de Lig4 en el ratón provoca una pérdida progresiva de células madre hematopoyéticas y celularidad de la médula ósea durante el envejecimiento. La sensibilidad de las células madre hematopoyéticas a la deficiencia de lig4 sugiere que el NHEJ mediado por lig4 es un determinante clave de la capacidad de las células madre para mantenerse frente al estrés fisiológico a lo largo del tiempo.

Interacciones

Se ha demostrado que LIG4 interactúa con XRCC4 a través de su dominio BRCT . Esta interacción estabiliza la proteína LIG4 en las células; las células que son deficientes para XRCC4 , como las células XR-1, tienen niveles reducidos de LIG4.

Mecanismo

LIG4 es una ADN ligasa dependiente de ATP. LIG4 usa ATP para adenilarse a sí mismo y luego transfiere el grupo AMP al fosfato 5 'de un extremo del ADN. El ataque nucleófilo por el grupo hidroxilo 3 'de un segundo extremo del ADN y la liberación de AMP producen el producto de ligación. La adenilación de LIG4 es estimulada por XRCC4 y XLF .

Referencias

Otras lecturas

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