Se celebraron cuatro referendos en Suiza durante 1939. Los dos primeros se celebraron el 22 de enero por una iniciativa popular sobre derechos civiles (que fue rechazada) y una resolución federal sobre el uso restringido de la cláusula de urgencia en la constitución (que fue aprobada). El tercero se llevó a cabo el 4 de junio sobre una enmienda constitucional sobre la financiación de las políticas gubernamentales de defensa y desempleo, y fue aprobado por los votantes. El cuarto se celebró el 3 de diciembre sobre una ley federal sobre la situación laboral y el seguro de los funcionarios públicos federales y fue rechazado por los votantes.
Los referéndums sobre la cláusula de urgencia y la financiación de las políticas de defensa y desempleo implicaron enmendar la constitución, y también fueron referéndums "obligatorios", que requerían una doble mayoría; mayoría del voto popular y mayoría de los cantones. La decisión de cada cantón se basó en el voto en ese cantón. Los cantones completos contaban como un voto, mientras que la mitad de los cantones contaban como la mitad. La iniciativa popular sobre los derechos civiles también requería una doble mayoría, mientras que el referéndum sobre los funcionarios públicos era un referéndum opcional , que solo requería una mayoría de votantes a favor para ser aprobado.