Base de datos de clasificación de transportadores - Transporter Classification Database

La base de datos de clasificación de transportadores (o TCDB ) es un sistema de clasificación aprobado por la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB) para proteínas de transporte de membrana , incluidos los canales iónicos .

Clasificación

El nivel superior de clasificación y algunos ejemplos de proteínas con estructura 3D conocida:

1. Canales y poros

1.A canales de tipo α

• 1.A.1 Superfamilia de canales iónicos activados por voltaje
• 1.A.2 Familia de canales K ⁺ rectificador de entrada
• 1.A.3 rianodina-inositol-1,4,5 trifosfato-receptor de Ca ²⁺ familia de canales
• 1.A.4 Potencial de receptor transitorio Familia de canales de Ca ²⁺
• 1.A.5 Familia de canales de cationes de policistina
• 1.A.6 epitelial de Na ⁺ familia de canales
• 1.A.7 Familia de canales de cationes del receptor P2X regulado por ATP
• 1.A.8 Superfamilia de proteínas intrínsecas principales
• 1.A.9 Receptor de neurotransmisores, bucle Cys, familia de canales iónicos activados por ligandos
• 1.A.10 Familia de receptores de neurotransmisores de canales iónicos activados por glutamato
• 1.A.11 Familia de transportadores de canales de amonio
• 1.A.12 Familia de canales de cloruro intracelular
• 1.A.13 Familia de canales de cloruro epitelial
• 1.A.14 Familia de transferencia de genes potenciada por testículos
• 1.A.15 Familia del canal 2 de cationes no selectivos
• 1.A.16 Familia de transportadores de formiato -nitrito
• 1.A.17 Familia de canales de cloruro dependientes de calcio
• 1.A.18 Familia Tic110 formadora de canales aniónicos con envoltura de cloroplasto
• 1.A.19 Familia de canales de matriz 2 del virus de la influenza tipo A
• 1.A.20 Familia de proteínas 3 que interactúan con BCL2 / Adenovirus E1B
• 1.A.21 Familia Bcl-2
• 1.A.22 Canal iónico mecanosensible de gran conductancia
• 1.A.23 Canal iónico mecanosensible de pequeña conductancia
• 1.A.24 Familia de conexinas formadoras de uniones huecas
• 1.A.25 Familia de las innexinas formadoras de uniones huecas
• 1.A.26 Familia del transportador E de Mg ²⁺
• 1.A.27 Familia Phospholemman
• 1.A.28 Familia de transportadores de urea
• 1.A.29 Familia de canales de urea / amida
• 1.A.30 H ⁺ - o Na ⁺ - superfamilia del motor flagelar MotAB bacteriano translocadora / ExbBD de transporte por membrana externa
• 1.A.31 Familia de anexos
• 1.A.32 Familia de canales NB del virus de la influenza tipo B
• 1.A.33 Familia de proteínas de choque térmico 70 formadoras de canales catiónicos
• 1.A.34 Familia de complejos formadores de canales tipo unión gap de Bacillus
• 1.A.35 Familia de transportadores de iones metálicos CorA
• 1.A.36 Familia de canales de cloruro intracelular
• 1.A.37 CD20 Ca ²⁺ familia de canales
• 1.A.38 Familia de reguladores de pH de Golgi
• 1.A.39 Familia de canales CM2 del virus de la influenza tipo C
• 1.A.40 Familia de canales de Vpu del virus de la inmunodeficiencia humana tipo I
• 1.A.41 Familia del reovirus aviar p10 Vvroporina
• 1.A.42 Familia de la proteína R viral del VIH
• 1.A.43 Familia de exportadores de fluoruro o resistencia al alcanfor
• 1.A.44 Proteína pb2 de la punta de la cola formadora de poros de la familia del fago T5
• 1.A.45 Familia del inyectisoma del fago P22
• 1.A.46 Familia de bestrofinas formadoras de canales aniónicos
• 1.A.47 Canal selectivo de aniones sensible a nucleótidos, familia ICln
• 1.A.48 Familia Tweety del canal aniónico
• 1.A.49 Familia de las viroporinas del coronavirus humano ns12.9
• 1.A.50 Familia de fosfolamban ( regulador de Ca ²⁺ y Ca ²⁺ -ATPasa)
• 1.A.51 La familia de canales de protones controlados por voltaje (VPC)
• 1.A.52 Familia de ^canales de Ca ²⁺ (CRAC) activados por liberación de Ca ²⁺ (CRAC-C)
• 1.A.53 Familia de canales selectivos de cationes de viroporina del virus de la hepatitis C P7 (VHC-P7)
• 1.A.54 Familia de canales de fuga Presenilin ER Ca ²⁺ (Presenilin)
• 1.A.55 El canal de Ca ²⁺ asociado a vesículas sinápticas , familia flor (flor)
• 1.A.56 La familia de transportadores de cobre (Ctr)
• 1.A.57 La viroporina del coronavirus del SARS humano (SARS-VP)
• 1.A.58 Familia de la proteína 2 de la matriz del virus de la influenza tipo B (BM2-C)
• 1.A.59 El péptido formador de poros del virus de la enfermedad de la bolsa, familia Pep46 (Pep46)
• 1.A.60 El péptido preformador de reovirus de mamíferos, familia Mu-1 (Mu-1)
• 1.A.61 Familia de la cadena F (péptido gamma) formadora de canales de nodavirus de insectos
• 1.A.62 Familia de canales catiónicos homotriméricos (TRIC)
• 1.A.63 La porina α-helicoidal de la membrana externa de Ignicoccus (familia I-OMP
• 1.A.64 Familia Plasmolipin (Plasmolipin)
• 1.A.65 Familia de la proteína de coronavirus viroporina E (viroporina E)
• 1.A.66 La familia Pardaxin (Pardaxin)
• 1.A.67 La familia de transportadores de membrana Mg ²⁺ (MMgT)
• 1.A.68 La familia de las viroporinas hidrófobas pequeñas virales (V-SH)
• 1.A.69 Familia de canales receptores de olores heteroméricos (HORC)
• 1.A.70 La molécula contra la familia de microbios A (MamA)
• 1.A.71 Familia de canales de proteínas solubles en ácido cerebral (canal BASP1)
• 1.A.72 La superfamilia Mer
• 1.A.73 Familia de proteínas de lisis de colicina (CLP)
• 1.A.74 La familia Mitsugumin 23 (MG23)
• 1.A.75 El nociceptor mecánico, familia piezo (piezo)
• 1.A.76 La familia de transportadores de magnesio1 (MagT1)
• 1.A.77 La familia Uniporter (MCU) Mg ²⁺ / Ca ²⁺
• 1.A.78 El canal selectivo de K ⁺ en la familia de endosomas y lisosomas (KEL)
• 1.A.79 La proteína de absorción de colesterol (ChUP) o la familia de absorción de ARN bicatenario
• 1.A.80 La familia NS4a Viroporin (NS4a)
• 1.A.81 La familia de canales de Ca ^{2+ de} baja afinidad (LACC)
• 1.A.82 Familia de canales de mecanotransducción de células ciliadas (HCMC)
• 1.A.83 Familia del virus SV40 Viroporin VP2 (SV40 VP2)
• 1.A.84 La familia de canales Ca ^{2+ del} modulador de la homeostasis del calcio (CALHM-C)
• 1.A.85 Familia de poliovirus 2B viroporina (2B viroporina)
• 1.A.86 Familia del virus del papiloma humano tipo 16 (VPH16) Viroporina L2 (Viroporina L2)
• 1.A.87 La familia de los canales de calcio mecanosensibles (MCA)
• 1.A.88 La familia de los canales de potasio fúngicos (F-Kch)
• 1.A.89 Familia de coronavirus humano 229E viroporina (229E viroporina)
• 1.A.90 Familia del metaneumovirus humano (HMPV) Viroporina (HMPV-Viroporina)
• 1.A.91 La proteína asexual 3.2 ligada a la citoadherencia de la familia Plasmodium falciparum (Clag3)
• 1.A.92 Familia de Reovirus Viroporin VP10 (RVP10)
• 1.A.93 Familia de la proteína no estructural 3 viroporina (NS3) del virus de la lengua azul
• 1.A.94 Familia de glicoproteína 4 viroporina (NSP4) no estructural del rotavirus
• 1.A.95 Familia de ephemerovirus viroporin (EVVP)
• 1.A.96 Familia de viroporinas del virus del polioma humano (PVVP)
• 1.A.97 Familia de las viroporinas E5 del virus del papiloma humano tipo 16 (VPH-E5)
• 1.A.98 Familia de la proteína P13 del virus linfotrópico T humano 1 (HTLV1-P13)
• 1.A.99 Familia de la proteína E de membrana pequeña del sobre del virus de la bronquitis infecciosa (IBV-E)
• 1.A.100 Familia de viroporinas putativas Rhabdoviridae, U5 (RV-U5)
• 1.A.101 Familia Pex11 (Pex11) formadora de poros peroxisomales
• 1.A.102 Familia de viroporina PB1-F2 (PB1-F2) de influenza A
• 1.A.103 Familia SH (SV5-SH) del virus de los simios 5 (virus de la parainfluenza 5)
• 1.A.104 El canal de Na ^{+ de} biosíntesis flagelar propuesto , familia FlaH (FlaH)
• 1.A.105 La familia de dominio de quinasa de linaje mixto (MLKL)
• 1.A.106 La familia de canales de calcio activados por carga de calcio (CLAC)
• 1.A.107 La familia de las globinas formadoras de poros (Globin)

1.B. Porinas β-barril y otras proteínas de la membrana externa

• 1.B.1 Familia de porinas bacterianas generales
• 1.B.2 Familia de la porina clamidial (CP)
• 1.B.3 Familia de la porina de azúcar (SP)
• 1.B.4 Familia de porinas de Brucella-Rhizobium (BRP)
• 1.B.5 Familia de porinas de Pseudomonas OprP (POP)
• 1.B.6 Familia de porinas OmpA-OmpF (OOP)
• 1.B.7 Familia de porinas Rhodobacter PorCa (RPP)
• 1.B.8 Familia de porinas mitocondriales y plástidas (MPP)
• 1.B.9 Familia de proteínas de la membrana externa FadL (FadL)
• 1.B.10 Familia de porinas de membrana externa formadoras de canales específicos de nucleósidos (Tsx)
• 1.B.11 Familia de porinas de ujier fimbrial de membrana externa (FUP)
• 1.B.12 Familia Autotransporter-1 (AT-1)
• 1.B.13 Familia de porinas de exportación de alginato (AEP)
• 1.B.14 Familia de receptores de membrana externa (OMR)
• 1.B.15 Familia de porina rafinosa (RafY)
• 1.B.16 Familia de amidas de cadena corta y urea porinas (SAP)
• 1.B.17 Familia del factor de membrana externa (OMF)
• 1.B.18 Familia de proteínas auxiliares de la membrana externa (OMA)
• 1.B.19 Familia de porinas OprB selectivas para glucosa (OprB)
• 1.B.20 Familia de secreción de dos parejas (TPS)
• 1.B.21 Familia de porinas OmpG (OmpG)
• 1.B.22 Familia de la secretina de la membrana bacteriana externa (secretina)
• 1.B.23 Familia de porinas cianobacterianas (CBP)
• 1.B.24 Porina micobacteriana
• 1.B.25 Familia de porinas de membrana externa (Opr)
• 1.B.26 Familia de la porina ciclodextrina (CDP)
• 1.B.31 Familia de Campylobacter jejuni oorin de la membrana externa principal (MomP)
• 1.B.32 Familia de porinas de membrana externa fusobacteriana (FomP)
• 1.B.33 Familia de porinas de inserción de proteínas de la membrana externa (complejo Bam) (OmpIP)
• 1.B.34 ​​Porinas corinebacterianas
• 1.B.35 Familia de porinas específicas de oligogalacturonato (KdgM)
• 1.B.39 Porina bacteriana, familia OmpW (OmpW)
• 1.B.42 Familia de porinas de exportación de lipopolisacáridos de membrana externa (LPS-EP)
• 1.B.43 Familia Coxiella porin P1 (CPP1)
• 1.B.44 Familia de porinas de Porphyromonas gingivalis (PorT) con traslocación de proteínas probables
• 1.B.49 Familia de porinas Anaplasma P44 (A-P44)
• 1.B.48 Transportadores tipo Curli
• 1.B.54 Intimina / invasina (Int / Inv) o Autotransporter-3 familia
• 1.B.55 Familia de poliacetil-D-glucosamina porina (PgaA)
• 1.B.57 Familia de proteínas de la membrana principal externa de Legionella (LM-OMP)
• 1.B.60 Familia de porina Omp50 (Porina Omp50)
• 1.B.61 Familia de la porina delta-proteobacteriana (delta-porina)
• 1.B.62 Familia de porinas bacterianas putativas (PBP)
• 1.B.66 Familia putativa de porina 2 de barril beta (BBP2)
• 1.B.67 Familia putativa de porina-4 de barril beta (BBP4)
• 1.B.68 Superfamilia de porina-5 de barril beta putativa (BBP5)
• 1.B.70 Familia de canales de membrana externa (OMC)
• 1.B.71 Familia de porinas proteobacterianas / verrucomicrobianas (PVP)
• 1.B.72 Familia de porinas de membrana externa de protoclamidias (PomS / T)
• 1.B.73 Familia de biogénesis / ensamblaje de cápsulas (CBA)
• 1.B.78 DUF3374 Familia de porinas asociadas al transporte de electrones (ETPorin)

1.C Toxinas formadoras de poros (proteínas y péptidos)

• 1.C.3 Familia de la α- hemolisina (αHL)
• 1.C.4 Familia de aerolisina
• 1.C.5 ε-toxina familia
• 1.C.11 Superfamilia de la toxina RTX
• 1.C.12 Complejo de ataque de membrana / superfamilia de perforina
• 1.C.13 Familia de las leucocidinas
• 1.C.14 Familia de citohemolisinas (CHL)
• 1.C.39 Familia de citolisina dependiente del colesterol activada por tiol
• 1.C.43 Familia de las liseninas
• 1.C.56 Familia de canales de cationes de Pseudomonas syringae HrpZ
• 1.C.57 Familia de citotoxinas clostridiales
• 1.C.58 La familia Microcin E492 / C24 (Microcin E492)
• 1.C.74 Familia de citotoxinas de serpiente (SCT)
• 1.C.97 Familia formadora de poros de pleurotolisina

1.D Canales no sintetizados ribosómicamente

• 1.D.1 La familia de canales de gramicidina A
• 1.D.2 La familia de las siringomicinas formadoras de canales
• 1.D.3 La familia Syringopeptina formadora de canales
• 1.D.4 La familia formadora de canales Tolaasin
• 1.D.5 Familia formadora de canales de antibióticos alameticina o peptaibol
• 1.D.6 La familia de canales complejos de poli 3-hidroxibutirato Ca ²⁺ (cPHB-CC)
• 1.D.7 La familia Beticolin
• 1.D.8 La familia de las saponinas
• 1.D.9 La familia de canales de iones de poliglutamina (PG-IC)
• 1.D.10 La familia de canales formadores de ceramidas
• 1.D.11 La familia de las surfactinas
• 1.D.12 La familia Beauvericin (Beauvericin)
• 1.D.13 Antibióticos péptidos anfipáticos de administración de ADN (DAPA)
• 1.D.14 Familia de péptidos formadores de canales anfipáticos Leu / Ser sintéticos (l / S-SCP)
• 1.D.15 La familia de la daptomicina (daptomicina)
• 1.D.16 Familia de heptapéptidos formadores de poros anfipáticos sintéticos (SAPH)
• 1.D.17 Familia de péptidos de hoja β, formadores de poros y de diseño combinatorio
• 1.D.18 Familia de conjugados de guanosina-ácido biliar formadores de poros
• 1.D.19 Fármaco formador de canales de Ca ²⁺ , familia de las digitoxinas
• 1.D.20 Familia de agentes fúngicos / antibióticos macrólidos poliénicos formadores de poros (PMAA)
• 1.D.21 Familia de nanoporos lipídicos (LipNP)
• 1.D.22 El pigmento carotenoide translocador de protones, familia de la zeaxantina
• 1.D.23 Familia de antimicrobianos formadores de poros de fenileno etinileno (PEPA)
• 1.D.24 Familia de la esponja marina politeonamida B (pTB)
• 1.D.25 La familia de los foldameros de arilamina (AAF)
• 1.D.26 La familia del alcohol dihidrodehidrodiconiferílico 9'-O-β-D-glucósido (DDDC9G)
• 1.D.27 La familia de isósteres Thiourea
• 1.D.28 La familia Lipopeptaibol
• 1.D.29 La familia de oligocolatos macrocíclicos
• 1.D.30 El pilar artificial con hidrazida adjunta [5] Familia de canales areno (HAPA-C)
• 1.D.31 La familia de la anfotericina B
• 1.D.32 Familia de las novicidinas formadoras de poros
• 1.D.33 Familia de politeonamida B formadora de canales
• 1.D.34 Bolaamphiphiles oligoéster formador de canales
• 1.D.35 Familia de lipodepsipéptidos cíclicos formadores de poros
• 1.D.36 La familia de canales de iones oligoborneno
• 1.D.37 La familia Hibicuslide C
• 1.D.38 Familia de nanotubos de péptidos cíclicos (cPepNT)
• 1.D.39 La familia de canales de iones moleculares anfifílicos anfifílicos basados ​​en azobenceno controlados por luz (AAM-IC)
• 1.D.40 Familia de poros toroidales lipídicos inducidos por proteínas
• 1.D.41 Familia de ionóforos de tipo sprotetonato (espirohexanolida)
• 1.D.42 La familia del canal de areno (TPPA-C) del pilar tripéptido Phe-Arg [5]
• 1.D.43 Familia de canales de dinucleósidos de guanosina adaptados a triazol (TT-GDN-C)
• 1.D.44 El canal de iones sintéticos con la familia de ferroceno activo redox (ICRF)
• 1.D.45 Familia de poros de membrana de electroporación y sonoporación (SEMP)
• 1.D.46 La familia DNA Nanopore (DnaNP)
• 1.D.47 Familia de péptidos cíclicos sintéticos formadores de poros (PSCP)
• 1.D.48 Familia de la siringomicina E formadora de poros
• 1.D.49 Familia de canales radicales carotenoides transmembrana (CRC)
• 1.D.50 Familia de transportadores de aniones anfifílicos bis-catecol (AC-AT)
• 1.D.51 La familia de nanoporos de proteínas (ProNP)
• 1.D.52 Familia de nanoporos de macrociclo de oligoamida aromático (OmnNP)
• 1.D.53 Familia de nanotubos de péptidos gamma alfa (a, gPepNT)
• 1.D.54 Familia de canales de iones hexil-benzoureido-15-corona-5-éter selectivos de potasio (HBEC)
• 1.D.55 La familia de nanoporos a base de porfirina (PorNP)
• 1.D.56 Familia de nanoporos oligoméricos alfa-aminoisobutirato (Aib) (AibNP)
• 1.D.57 La familia Lipid Electro-Pore (LEP)
• 1.D.58 Familia de prodigioseno que transporta aniones (prodigioseno)
• 1.D.59 Familia de la perenosina transportadora de aniones (perenosina)
• 1.D.60 La familia de péptidos alfa, gamma-cíclicos (AGCP)
• 1.D.61 Familia de 2,6-bis (bencimidazol-2-il) piridina (ABBP) anionofórica
• 1.D.62 Familia formadora de canales derivados de bis-triazolil diGuanosina (TDG)
• 1.D.63 La familia de nanoporos basados ​​en péptidos (PepNP)
• 1.D.64 La familia de nanotubos de carbono (CarNT)
• 1.D.65 Familia de anfidinol formador de poros (Amphidinol)
• 1.D.66 Familia de nanoporos de macromoléculas helicoidales (HmmNP)
• 1.D.67 Familia de canales iónicos de péptidos helicoidales modificados con éter Crown (CEHP)
• 1.D.68 Familia de polímeros de bloque pleurónico formadores de poros (PPBP)
• 1.D.69 La familia de nanoporos cónicos (ConNP)
• 1.D.70 La familia de nanoporos metálicos (Au / Ag / Pt / grafeno) (MetNP)
• 1.D.71 La familia de péptidos sintéticos TP359 (TP359)
• 1.D.72 Familia de receptores de trípode basados ​​en triazina portadores de cloruro (CCTTR)
• 1.D.73 La familia de nanoporos de sílice mesoporosa (SilNP)
• 1.D.74 Familia de poros de duela de p-octifenilo rígido sintético sensible a estímulos (SSROP)

1.E Holins

1.F la fusión de vesículas poros

• 1.F.1 Familia de poros de fusión de vesículas sinaptosómicas (SVF-Pore)
• 1.F.2 La familia de exoquistes (exocistos) octaméricos

1.G Poros de fusión viral

• 1.G.1 Familia de la proteína de fusión de membranas formadoras de poros virales-1 (VMFP1)
• 1.G.2 Familia de la proteína de fusión de membranas formadoras de poros virales-2 (VMFP2)
• 1.G.3 Familia de la proteína de fusión de la membrana formadora de poros virales-3 (VMFP3)
• 1.G.4 Familia de la proteína de fusión 4 de la membrana formadora de poros virales (VMFP4)
• 1.G.5 Familia de la proteína de fusión de la membrana formadora de poros virales-5 (VMFP5)
• 1.G.6 Familia de la proteína de fusión hepadnaviral S (proteína VHB-S)
• 1.G.7 La familia de proteínas de fusión Reovirus FAST (R-FAST)
• 1.G.8 Familia de proteínas de fusión de arenavirus (AV-FP)
• 1.G.9 La familia Syncytin (Syncytin)
• 1.G.10 Familia del complejo de fusión de membranas del virus del herpes simple (HSV-MFC)
• 1.G.11 Familia del complejo de proteínas de entrada de células de poxvirus (PEP-C)
• 1.G.12 Familia de la proteína de fusión gp95 del virus de la leucosis aviar (ALV-gp95)
• 1.G.13 Familia de transmembrana pequeña asociada a la fusión de ortoreovirus (FAST)
• 1.G.14 Familia de proteínas formadoras de poros de fusión / hemaglutinina del virus de la influenza (Influenza-H / FPP)
• 1.G.15 Familia de glicoproteínas de envolvente principal GP64 (GP64) del virus de la poliedrosis nuclear de Autographa californica
• 1.G.16 Familia de péptidos de fusión (VIH-FP) del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1)
• 1.G.17 Familia de glicoproteínas de la envoltura del virus de la leucemia bovina (BLV-Env)
• 1.G.18 El péptido de fusión SARS-CoV en la familia de precursores de glicoproteína de pico (SARS-FP)
• 1.G.19 Familia del complejo de fusión de membranas formadoras de poros de rotavirus (Rotavirus MFC)
• 1.G.20 La familia de glicoproteínas de fusión de envoltura de hantavirus Gc (Gc-EFG)
• 1.G.21 El virus de Epstein Barr (virus del herpes humano 4) Familia Gp42 (Gp42)
• 1.G.22 Familia de glicoproteínas gO (gO) del citomegalovirus (virus del herpes humano 5)

1.H Canales paracelulares

• 1.H.1 La familia Claudin Tight Junction (Claudin1)
• 1.H.2 Familia de invertebrados PMP22-Claudin (Claudin2)

1.I Canales unidos a membrana

• 1.I.1 Familia de complejos de poros nucleares , incluidas las carioferinas
• 1.i.2 Planta plasmodesmos familia

2. Transportadores impulsados ​​por potencial electroquímico

2.A Porteadores ( uniportadores , simportadores , antiportadores )

• 2.A.1 Superfamilia de facilitadores principales (MFS), ver también Permeasa de lactosa , Permeasa de fosfato y Transportador de glucosa
• 2.A.2 El glucósido-pentosido-hexurónido (GPH): familia de transportadores de cationes
• 2.A.3 La familia de aminoácidos-poliaminas-organocation (APC)
• 2.A.4 Familia facilitadora de la difusión de cationes (CDF)
• 2.A.5 Zinc (Zn ²⁺ ) -Hierro (Fe ²⁺ ) Permeasa Familia
• 2.A.6 Superfamilia de división celular de resistencia- modulación , ver también proteína de membrana de exportación de proteína SecDF
• 2.A.7 La superfamilia de transportadores de fármacos / metabolitos (DMT)
• 2.A.8 La familia gluconato: H ⁺ Symporter (GntP)
• 2.A.9 La familia de insertosas de proteínas de membrana (YidC / Alb3 / Oxa1)
• 2.A.10 La familia del transportador 2-ceto-3-desoxigluconato (KdgT)
• 2.A.11 La familia Citrate-Mg ²⁺ : H ⁺ (CitM) Citrate-Ca ²⁺ : H ⁺ (CitH) Symporter (CitMHS)
• 2.A.12 ATP: Familia ADP Antiporter
• 2.A.13 Familia de absorción de dicarboxilato de C4 (Dcu)
• 2.A.14 Familia de lactato permeasa
• 2.A.15 Familia de transportadores de betaína / carnitina / colina (BCCT)
• 2.A.16 Familia de transportadores de dicarboxilato / resistencia a telurito
• 2.A.17 Familia de transportadores de oligopéptidos dependientes de protones
• 2.A.18 Familia de aminoácidos / auxinas permeasas (AAAP)
• 2.A.19 La familia Ca ²⁺ : Cation Antiporter (CaCA)
• 2.A.20 La familia de transportadores de fosfato inorgánico (PiT)
• 2.A.21 Solute: Familia de simportadores de sodio
• 2.A.22 El neurotransmisor: familia de simportadores de sodio
• 2.A.23 Familia dicarboxilato / aminoácido: simportador catiónico (Na ⁺ o H ⁺ ) (DAACS)
• 2.A.24 La familia de transportadores de 2-hidroxicarboxilato (2-HCT)
• 2.A.25 Alanina o glicina: Familia de transportadores de cationes (AGCS)
• 2.A.26 Familia de aminoácidos de cadena ramificada: simportadores de cationes (LIVCS)
• 2.A.27 El glutamato: Na ⁺ Symporter (ESS) de la familia
• 2.A.28 ácido biliar: Na ⁺ Symporter Familia
• 2.A.29 Familia de portadores mitocondriales
• 2.A.30 Familia de cotransportadores de cloruro de cationes (CCC)
• 2.A.31 Familia de intercambiadores de aniones
• 2.A.32 La familia de transportadores de silicio (Sit)
• 2.A.33 NhaA Na ⁺ : Familia H ⁺ Antiporter (NhaA)
• 2.A.34 La familia NhaB Na ⁺ : H ⁺ Antiporter (NhaB)
• 2.A.35 La familia NhaC Na ⁺ : H ⁺ Antiporter (NhaC)
• 2.A.36 Catión monovalente: Familia Proton Antiporter-1 (CPA1)
• 2.A.37 Catión monovalente: Familia Proton Antiporter-2 (CPA2)
• 2.A.38 K ⁺ Transporter (Trk) Familia
• 2.A.39 Nucleobase: Familia catiónica Symporter-1 (NCS1)
• 2.A.40 Nucleobase: Familia catiónica Symporter-2 (NCS2)
• 2.A.41 Familia de transportadores de nucleósidos concentrados (CNT)
• 2.A.42 La familia de la permeasa de aminoácidos hidroxi / aromáticos (HAAAP)
• 2.A.43 Familia de transportadores de cistina lisosomal (LCT)
• 2.A.45 Familia de eflujo de arsenito-antimonita
• 2.A.46 La familia Benzoato: H ⁺ Symporter (BenE)
• 2.A.47 anión divalente: Na ⁺ Symporter (DASS) Familia
• 2.A.48 Familia de portadores de folato reducido (RFC)
• 2.A.49 Familia de canal / portador de cloruro (ClC)
• 2.A.50 Familia de absorción de glicerol (GUP)
• 2.A.51 Familia de transportadores de iones cromados (CHR)
• 2.A.52 La familia de transportadores Ni ²⁺ -Co ²⁺ (NiCoT)
• 2.A.53 Familia de permeasas de sulfato (SulP)
• 2.A.54 Familia de portadores de tricarboxilato mitocondrial (MTC)
• 2.A.55 El ión metálico (Mn ²⁺ -iron) Transportador (Nramp) Familia
• 2.A.56 La familia de transportadores periplásmicos tripartitos independientes de ATP (TRAP-T)
• 2.A.57 La familia de transportadores de nucleósidos equilibrantes (ENT)
• 2.A.58 La familia del simportador fosfato: Na ⁺ (PNaS)
• 2.A.59 La familia de resistencia al arsénico-3 (ACR3)
• 2.A.60 Familia de transportadores de aniones orgánicos (OAT)
• 2.A.61 Familia de absorción de dicarboxilato C4 C (DcuC)
• 2.A.62 La familia NhaD Na ⁺ : H ⁺ Antiporter (NhaD)
• 2.A.63 El catión monovalente (K ⁺ o Na ⁺ ): familia Proton Antiporter-3 (CPA3)
• 2.A.64 Familia de focalización de arginina gemela (Tat)
• 2.A.65 Familia de transportadores de bilirrubina (BRT)
• 2.A.66 Superfamilia de Flippasa Multifármaco / Oligosacaridil-lípido / Polisacárido (MOP)
• 2.A.67 La familia de transportadores de oligopéptidos (OPT)
• 2.A.68 Familia de transportadores de p-aminobenzoil-glutamato (AbgT)
• 2.A.69 La familia de portadores de eflujo de auxina (AEC)
• 2.A.70 La familia Malonate: Na ⁺ Symporter (MSS)
• 2.A.71 Familia de transportadores de folato-biopterina (FBT)
• 2.A.72 La familia de K ⁺ Uptake Permease (KUP)
• 2.A.73 Familia de absorción de ácidos grasos de cadena corta (AtoE)
• 2.A.74 La familia de transportadores endosomales multifármacos (MET) de 4 TMS
• 2.A.75 La familia de exportadores de L-lisina (LysE)
• 2.A.76 La familia de la resistencia a la homoerina / treonina (RhtB)
• 2.A.77 La familia de resistencia al cadmio (CadD)
• 2.A.78 La familia de exportadores de aminoácidos de cadena ramificada (LIV-E)
• 2.A.79 Familia de exportadores de treonina / serina (ThrE)
• 2.A.80 La familia de transportadores de tricarboxilato (TTT)
• 2.A.81 El aspartato: familia del intercambiador de alanina (AAEx)
• 2.A.82 La familia de transportadores de solutos orgánicos (OST)
• 2.A.83 La familia de transportadores de bicarbonato (SBT) dependientes de Na ⁺
• 2.A.84 La familia de exportadores de cloroplasto maltosa (MEX)
• 2.A.85 La familia de exportadores de ácidos aromáticos (ArAE)
• 2.A.86 La familia Autoinducer-2 Exporter (AI-2E) (anteriormente, la familia PerM, TC # 9.B.22)
• 2.A.87 Familia de transportadores de riboflavina procariótica (P-RFT)
• 2.A.88 Familia de transportadores de absorción de vitaminas (VUT o ECF)
• 2.A.89 La familia de transportadores de hierro Vacuolar (VIT)
• 2.A.90 Familia de receptores / transportadores de vitamina A (STRA6)
• 2.A.91 Complejo de importación de ARNt mitocondrial (M-RIC) (anteriormente 9.C.8)
• 2.A.92 Familia tipo transportador de colina (CTL)
• 2.A.94 La familia de la fosfato permeasa (Pho1)
• 2.A.95 La familia de transportadores de aminoácidos neutros (NAAT) 6TMS
• 2.A.96 Familia de transportadores de absorción de acetato (AceTr)
• 2.A.97 Familia de intercambiadores de membrana interna mitocondrial K ⁺ / H ⁺ y Ca ²⁺ / H ⁺ (LetM1)
• 2.A.98 La familia de supuestos exportadores de sulfato (PSE)
• 2.A.99 La familia de transportadores de captación 6TMS Ni ²⁺ (HupE-UreJ)
• 2.A.100 La familia Ferroportin (Fpn)
• 2.A.101 La familia de absorción de malonatos (MatC) (anteriormente UIT1)
• 2.A.102 La familia de permeasa de absorción de sulfonato de 4-tolueno (TSUP)
• 2.A.103 La familia de exportadores de precursores de mureína bacteriana (MPE)
• 2.A.104 La familia de exportadores de L-alanina (AlaE)
• 2.A.105 Familia de portadores de piruvato mitocondrial (MPC)
• 2.A.106 La familia Ca ²⁺ : H ⁺ Antiporter-2 (CaCA2)
• 2.A.107 La familia de exportadores MntP Mn ²⁺ (MntP)
• 2.A.108 La familia de transportadores de hierro / plomo (ILT)
• 2.A.109 La familia de resistencia a iones de telurio (TerC)
• 2.A.110 El transportador de hemo, familia de proteínas génicas sensibles al hemo (HRG)
• 2.A.111 La familia Na ⁺ / H ⁺ Antiporter-E (NhaE)
• 2.A.112 Familia de antígenos del grupo sanguíneo KX (KXA)
• 2.A.113 La familia de transportadores de níquel / cobalto (NicO)
• 2.A.114 La supuesta familia CstA (CstA) del transportador de péptidos por inanición de carbono
• 2.A.115 La familia de exportadores de novobiocina (NbcE)
• 2.A.116 La familia de proteínas de tratamiento de peptidoglicolípidos (GAP)
• 2.A.117 La familia de exportadores de clorhexadina (CHX)
• 2.A.118 La familia de antiportadores de aminoácidos básicos (ArcD)
• 2.A.119 La familia de exportadores de organoarsenical (ArsP)
• 2.A.120 La familia putativa de permeasas de aminoácidos (PAAP)
• 2.A.121 La familia de transportadores de sulfato (CysZ)
• 2.A.122 La familia de proteínas auxiliares de tipo holina LrgB / CidB (LrgB / CidB)
• 2.A.123 El dulce; Bucle PQ; Saliva; Familia MtN3 (dulce)
• 2.A.124 La familia de exportadores de lisina (LysO)
• 2.A.125 La familia de transportadores eucariotas de riboflavina (E-RFT)
• 2.A.126 La familia de exportadores de ácidos grasos (FAX)
• 2.A.127 Familia de transportadores de cardiolipina enterobacteriana (CLT)

2.B Porters sintetizados no ribosómicamente

• 2.B.1 Familia de portadores de valinomicina
• 2.B.2 La monensina Familia
• 2.B.3 La familia nigericina
• 2.B.4 La familia de antibióticos macrotetrolida (MA)
• 2.B.5 La familia de poliéteres macrocíclicos (MP)
• 2.B.6 El ionomicina Familia
• 2.B.7 La familia de translocación de péptidos fosfolípidos α-helicoidales transmembrana (TMP-PLT)
• 2.B.8 La familia de la bafilomicina A1 (bafilomicina)
• 2.B.9 La familia funcional del péptido penetrante celular (CPP)
• 2.B.10 El CPP sintético, familia Transportan
• 2.B.11 Familia de ionóforos tipo portador de calcimicina o A23187
• 2.B.12 La familia de la salinomicina
• 2.B.13 Familia de antiportadores de aniones macrocíclicos tetrapirrólicos (TPMC-AA)
• 2.B.14 La familia de ionóforos (Lasalocid) Lasalocid A o X-537A
• 2.B.15 La familia de portadores de cloruro basados ​​en trípode de tris-tiourea (TTT-CC)
• 2.B.16 Familia de portadores de aniones compuestos que contienen enlaces halógenos (HCAC)
• 2.B.17 El derivado de isoftalamina H ⁺ : Cl ^- Familia de cotransportadores (IDC)
• 2.B.18 El derivado de piridina-2,6-dicarboxamina (PDCA) H +: Cl ^- Familia de cotransportadores
• 2.B.19 Familia de derivados de pirrol (C4P) de Calix (4)
• 2.B.20 Familia de intercambiadores de cloruro / bicarbonato de prodigiosina (prodigiosina)
• 2.B.21 Familia de transportadores de aniones derivados de orto-fenilendiamina-bis-urea (oPDA-U)
• 2.B.22 Familia de transportadores de aniones funcionalizados con imidazolio (IAT)
• 2.B.23 La transmembrana homotetramérica Zn ²⁺ / Co ²⁺ : Antipportador sintético de protones, familia Rocker (Rocker)
• 2.B.24 Familia de portadores de aniones de 2,6-bis (bencimidazol-2-il) piridina (BBP-AC)
• 2.B.25 La familia de flip-flop lipídicos mediada por péptidos (PLFF)
• 2.B.26 Familia del conjugado bis (choloilo) funcionalizado con bis (imidazolilo) (BIBCC)
• 2.B.27 La familia de transportadores de aniones tris-urea
• El 2.B.29 Anionophoric Marina alcaloide Tambjamine Familia

2.C Energizadores impulsados ​​por gradientes de iones

• 2.C.1 Familia de proteínas auxiliares TonB-ExbB-ExbD / TolA-TolQ-TolR (TonB) para la activación del transporte activo mediado por el receptor de membrana externa (OMR)

3. Transportadores activos primarios

3.A. Transportadores impulsados ​​por hidrólisis con enlaces de PP

• 3.A.1 Transportadores ABC que incluyen BtuCD, transportador de captación de molibdato, regulador de conductancia transmembrana de fibrosis quística y otros
• 3.A.2 El H ⁺ - o Na ⁺ -translocating de tipo F ATPasa , del tipo en V de la ATPasa y de tipo A ATPasa superfamilia
• 3.A.3 La superfamilia de ATPasa tipo P
• 3.A.4 La familia de eflujo de arsenito-antimonita
• 3.A.5 Vía secretora general (Sec) translocón (preproteína translocasa SecY)
• 3.A.6 La familia de la vía secretora de tipo III (relacionada con la virulencia) (IIISP)
• 3.A.7 La familia de la vía secretora (IVSP) de tipo IV (transferencia de proteína de ADN conyugal o VirB)
• 3.A.8 La familia de proteínas translocasas mitocondriales (MPT)
• 3.A.9 La familia de la proteína de envoltura de cloroplasto Translocase (CEPT o Tic-Toc)
• 3.A.10 H ⁺ , Na ⁺ -translocating Pyrophosphatase familia
• 3.A.11 La familia de transportadores de transformación de ADN relacionados con la competencia bacteriana (ADN-T)
• 3.A.12 La familia de translocadores de ADN septal (S-DNA-T)
• 3.A.13 La familia de exportadores de fagos filamentosos (FPhE)
• 3.A.14 La familia de exportadores de proteínas / fimbrilina (FPE)
• 3.A.15 Familia de ramas terminales principales secretoras de proteínas de la membrana externa (MTB)
• 3.A.16 La familia del retrotranslocón reticular endoplásmico (ER-RT)
• 3.A.17 La familia del inyectisoma del fago T7 (inyectisoma T7)
• 3.A.18 La familia de exportadores de ARNm nuclear (ARNm-E)
• 3.A.19 La familia TMS Recognition / Insertion Complex (TRC)
• 3.A.20 La familia de importadores de proteínas peroxisómicas (PPI)
• 3.A.21 Familia del complejo de inserción / biogénesis de proteínas de membrana anclada en la cola C-terminal (TAMP-B)
• 3.A.22 La familia del complejo de exportación de ARNm nuclear TREX / TAP acoplado a transcripción (TREX)
• 3.A.23 Familia de la vía secretora de simbiosis / virulencia (VISP) de tipo VI
• 3.A.24 Familia de sistemas de secreción de proteínas de tipo VII o ESX (T7SS)
• 3.A.25 La familia de maquinaria similar a ERAD (SELMA) específica de Symbiont
• 3.A.26 Familia Plasmodium Translocon de proteínas exportadas (PTEX)

3.B Transportadores impulsados ​​por descarboxilación

• 3.B.1 Familia de la descarboxilasa del ácido carboxílico que transporta Na ⁺ (NaT-DC)

3.C Transportadores impulsados ​​por transferencia de metilo

• 3.C.1 La metiltetrahidrometanopterina transportadora de Na ⁺ : familia de la coenzima M metiltransferasa (NaT-MMM)

3.D. Transportadores impulsados ​​por oxidorreducción

Incluyen una serie de proteínas transmembrana similares al citocromo b , incluida la coenzima Q - citocromo c reductasa (citocromo bc1); complejo de citocromo b6f ; formiato deshidrogenasa, nitrato reductasa respiratoria ; succinato - coenzima Q reductasa (fumarato reductasa); y succinato deshidrogenasa . Ver cadena de transporte de electrones .

• 3.D.1 La familia de la NADH deshidrogenasa ("complejo I") translocadora de H ⁺ o Na ⁺
• 3.D.2 La familia de las transhidrogenasas translocadoras de protones (PTH)
• 3.D.3 El quinol translocador de protones: citocromo c reductasa ) Superfamilia
• 3.D.4 Superfamilia de citocromo oxidasa translocadora de protones (COX)
• 3.D.5 La familia de NADH: quinona deshidrogenasa (Na-NDH o NQR) translocadora de Na ⁺
• 3.D.6 La supuesta NADH translocante de iones (H ⁺ o Na ⁺ ): familia de ferredoxina oxidorreductasa (NFO o RNF)
• 3.D.7 La familia H ₂ : heterodisulfuro oxidorreductasa (HHO)
• 3.D.8 Familia de formilmetanofurano deshidrogenasa de bombeo de Na ⁺ o H ⁺ (FMF-DH)
• 3.D.9 La familia de la deshidrogenasa F420H2 (F420H2DH) de translocación de H ⁺
• 3.D.10 Familia de succinato deshidrogenasa procariota (SDH)

3.E. Transportadores impulsados ​​por absorción de luz

• Proteínas similares a la bacteriorrodopsina , incluida la rodopsina (ver también opsina )
• Centros de reacción fotosintética bacteriana y fotosistemas I y II
• Complejos de captación de luz de bacterias y cloroplastos

4. Translocadores de grupo

4.A Translocadores grupales impulsados ​​por fosfotransferencias

• 4.A.1 La familia glucosa-glucósido (Glc) de PTS
• 4.A.2 La familia PTS fructosa-manitol (Fru)
• 4.A.3 La familia PTS Lactosa-N, N'-Diacetilchitobiosa-β-glucósido (Lac)
• 4.A.4 La familia del glucitol (intestino) de PTS
• 4.A.5 La familia PTS Galactitol (Gat)
• 4.A.6 La familia PTS manosa-fructosa-sorbosa (hombre)
• 4.A.7 La familia PTS L-ascorbato (L-Asc)

4.B Transportadores de captación de ribonucleósidos de nicotinamida

• 4.B.1 La familia de permeasa de captación de ribonucleósidos de nicotinamida (NR) (PnuC)

Transportadores acoplados a ligasa 4.C Acil CoA

• 4.C.1 La familia de transportadores de ácidos grasos (FAT) propuesta
• 4.C.2 Familia de la carnitina O-acil transferasa (CrAT)
• 4.C.3 Familia de acil-CoA tioesterasa (AcoT)

4.D Polisacárido sintasa / Exportadores

• 4.D.1 La familia putativa de polimerización de glicosilo vectorial (VGP)
• 4.D.2 La familia de glucosil transferasa 2 (GT2)
• 4.D.3 Familia de glicanos glucosil transferasa (OpgH)

4.E. Translocadores de grupo catalizados por polifosfato vacuolar polimerasa

• 4.E.1 La familia de polifosfato polimerasa (V-PPP) vacuolar (acidocalcisoma)

5. Transportadores de electrones

5.A Portadores de transferencia transmembrana de 2 electrones

• 5.A.1 Familia de enlaces disulfuro oxidorreductasa D (DsbD)
• 5.A.2 Familia de enlaces disulfuro oxidorreductasa B (DsbB)
• 5.A.3 Familia de oxidorreductasa (PMO) que contiene molibdopterina procariota

5.B Portadores de transferencia transmembrana de 1 electrón

• 5.B.1 El Fagocito ( gp91 ) NADPH oxidasa Familia
• 5.B.2 La familia eucariota del citocromo b561 (Cytb561)
• 5.B.3 La familia de transferencia de electrones de nanocables de Geobacter (G-NET)
• 5.B.4 La familia de supercomplejos del fotosistema I de plantas (PSI)
• 5.B.5 La familia de oxido-reductasa de metales extracelulares (EMOR)
• 5.B.6 Familia de la reductasa férrica de la proteína 3 del antígeno epitelial transmembrana (STEAP)
• 5.B.7 La familia YedZ (YedZ)
• 5.B.8 La familia del complejo de citocromo / porina de transferencia de electrones de membrana transexual (ET-PCC)
• 5.B.9 La familia de porina-citocromo c (Cyc2)

8. Factores accesorios que intervienen en el transporte

8.A Proteínas de transporte auxiliares

8.B Toxinas proteicas / peptídicas sintetizadas ribosómicamente que se dirigen a canales y portadores

8.C Toxinas no sintetizadas ribosómicamente que se dirigen a canales y portadores

9. Sistemas de transporte incompletamente caracterizados

9.A Transportadores reconocidos de mecanismo bioquímico desconocido

9.B Proteínas de transporte putativas

9.C Transportadores funcionalmente caracterizados que carecen de secuencias identificadas

Referencias

enlaces externos

• Base de datos de clasificación de transportadores
• Lista en qmul.ac.uk
• Saier MH, Tran CV, Barabote RD (enero de 2006). "TCDB: la base de datos de clasificación de transportadores para información y análisis de proteínas de transporte de membrana" . Ácidos nucleicos Res . 34 (Problema de la base de datos): D181–6. doi : 10.1093 / nar / gkj001 . PMC  1334385 . PMID  16381841 .
• Busch W., Saier MH (2002). "El sistema de clasificación de transportadores (TC), 2002". Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 37 (5): 287–337. doi : 10.1080 / 10409230290771528 . PMID  12449427 . S2CID  10558982 .
• Clasificación de transportadores humanos en farmacología