Sec61 - Sec61
| SecE / Sec61γ | |||||||||
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| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | SecE | ||||||||
| Pfam | PF00584 | ||||||||
| InterPro | IPR001901 | ||||||||
| PROSITE | PS01067 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhz / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| Proteína OPM | 1rhz | ||||||||
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| SecG / Sec61β, arqueoeucariota | |||||||||
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| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Sec61_beta | ||||||||
| Pfam | PF03911 | ||||||||
| InterPro | IPR016482 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhz / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
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| SecG, bacteriano | |||||||||
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| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | SecG | ||||||||
| Pfam | PF03840 | ||||||||
| InterPro | IPR004692 | ||||||||
| Proteína OPM | 5aww | ||||||||
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Sec61 , denominado SecYEG en procariotas, es un complejo de proteínas de membrana que se encuentra en todos los dominios de la vida. Como componente central del translocón , transporta proteínas al retículo endoplásmico en eucariotas y fuera de la célula en procariotas. Es un poro en forma de rosquilla a través de la membrana con 3 subunidades diferentes (heterotrimérica), SecY (α), SecE (γ) y SecG (β). Tiene una región llamada tapón que bloquea el transporte dentro o fuera de la sala de emergencias. Este tapón se desplaza cuando la región hidrófoba de un polipéptido naciente interactúa con otra región de Sec61 llamada costura, lo que permite la translocación del polipéptido en la luz del RE.
Estructura
Gran parte del conocimiento sobre la estructura del poro SecY / Sec61α proviene de una estructura de cristalografía de rayos X de su versión arqueal . La gran subunidad SecY consta de dos mitades, segmentos transmembrana 1-5 y segmentos transmembrana 6-10. Están unidas en el lado extracelular por un bucle entre los segmentos transmembrana 5 y 6. SecY puede abrirse lateralmente en la parte delantera (puerta lateral). SecE es una proteína de membrana de expansión única en la mayoría de las especies. Se encuentra en la parte posterior de SecY, envolviendo las dos mitades de SecY. Secβ (SecG) no es esencial. Se encuentra en el lateral de SecY y solo hace unos pocos contactos con él. En una vista lateral, el canal tiene forma de reloj de arena, con un embudo citoplasmático que está vacío y un embudo extracelular que se llena con una pequeña hélice, llamada tapón. En el medio de la membrana hay una construcción, formada por un anillo de poros de aminoácidos hidrófobos que proyectan sus cadenas laterales hacia adentro. Durante la translocación de proteínas, el tapón se quita del camino y una cadena polipeptídica se mueve desde el embudo citoplasmático, a través del anillo poroso, el embudo extracelular, hacia el espacio extracelular. Los segmentos hidrófobos de las proteínas de membrana salen lateralmente a través de la puerta lateral hacia la fase lipídica y se convierten en segmentos que atraviesan la membrana.
Por taxón
El canal SecYEG bacteriano interactúa con las secuencias señal de proteínas secretoras, así como con SecA , una ATPasa que impulsa la translocación. SecY es una proteína integral de la membrana de la membrana plasmática de 419 a 492 residuos de aminoácidos que normalmente contiene 10 regiones transmembrana (TM), 6 citoplasmáticas y 5 periplásmicas.
En lugar de SecA, el translocón eucariota puede utilizar el biP del chaperón lumenal ER para impulsar la translocación.
El translocón archaeal es menos conocido. Podría usar SecDF - YajC y YidC como bacterias, ya que se han encontrado homólogos. Aún no se ha identificado una ATPasa.
Específicos de la especie
Proteínas humanas:
La levadura en ciernes tiene dos de estos complejos homólogos ; el esencial se llama Sec61 y el no esencial se llama Ssh1. Como Sec61, Ssh1 se acopla al ribosoma.
Ver también
Referencias
- Alberts, Bruce y col. Biología molecular de la célula. Garland, 2002. ISBN 0-8153-3218-1
enlaces externos
- Proteína SEC61 + en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .