precursor de microARN mir-29 - mir-29 microRNA precursor
| precursor de microARN mir-29 | |
|---|---|
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| Identificadores | |
| Símbolo | mir-29 |
| Rfam | RF00074 |
| miRBase | MI0000087 |
| familia miRBase | MIPF0000009 |
| Otros datos | |
| Tipo de ARN | Gene ; miARN |
| Dominio (s) | Eucariota |
| IR | IR: 0035195 IR: 0035068 |
| ASI QUE | SO: 0001244 |
| Estructuras PDB | PDBe |
El precursor de microARN miR-29 , o pre-miARN, es una pequeña molécula de ARN en forma de vástago o horquilla . Cada brazo de la horquilla se puede procesar en un miembro de una familia estrechamente relacionada de ARN cortos no codificantes que participan en la regulación de la expresión génica . Los productos procesados o "maduros" de la molécula precursora se conocen como microARN (miARN) y se han predicho o confirmado en una amplia gama de especies ( ver 'MIPF0000009' en miRBase: la base de datos de microARN ).
procesamiento de miARN
Los miARN animales se transcriben primero como una molécula de miARN primaria. Este "pri-miRNA" puede contener una o más horquillas precursoras, que se liberan del pri-miRNA por la enzima nuclear Drosha . La horquilla precursora de aproximadamente 70 nucleótidos se exporta desde el núcleo y posteriormente se procesa por la enzima Dicer para dar un miARN maduro que tiene una longitud promedio de 22 nucleótidos. Cualquiera de los brazos del precursor puede producir un ARN maduro, aunque el brazo 3 '(3p) o el brazo 5' (5p) se procesa preferentemente y se carga en el complejo silenciador inducido por ARN (RISC) en la mayoría de los casos. Para el precursor de miR-29, el brazo 3 'del ARN precursor produce el producto predominantemente predominante (miR-29 o miR-29-3p), aunque el brazo 5' (miR-29 * o miR-29-5p) tiene también ha sido verificado experimentalmente.
La familia miR-29
Muchos genomas de mamíferos codifican cuatro precursores de miR-29 estrechamente relacionados que se transcriben en dos unidades transcripcionales. Por ejemplo, miR-29a y miR-29b-1 humanos se procesan a partir de un intrón de una transcripción larga no codificante (LOC646329) del cromosoma 7. miR-29b-2 (idéntica en secuencia a miR-29b-1) y miR -29c se co-transcriben a partir del cromosoma 1. Los tres miARN maduros principales procesados a partir de estos precursores se conocen como has-miR-29a, has-miR-29b y has-miR-29c.
El análisis de supervivencia en tres conjuntos de datos independientes muestra que hsa-miR-29c está asociado con la supervivencia en el cáncer de mama.
Blancos del miR-29
Se cree que los productos maduros ejercen funciones reguladoras al unirse con complementariedad parcial a elementos de reconocimiento de microARN (MRE) en la región no traducida 3 '(UTR 3') de las transcripciones diana. La evidencia experimental sugiere que los objetivos putativos de los productos maduros de miR-29 incluyen los siguientes:
- La proteína de diferenciación de células de leucemia mieloide (MCL1), un miembro antiapoptótico de la familia de proteínas Bcl-2 .
- El TCL1A (leucemia de células T / linfoma 1) oncogén , se encontró que ser interrumpido en muchas de las células T leucemias , pero también dysregulated tumores malignos de células B.
- ADN metiltransferasas DNMT3A y DNMT3B , que con frecuencia están reguladas al alza en el cáncer de pulmón .
- Homólogo de la proteína 36 del dedo de zinc (ZFP36), también conocida como tristetraprolina (TTP), un gen antiinflamatorio y anticancerígeno.
- El factor 4 asociado al receptor del factor de necrosis tumoral (TRAF4) se identificó como diana de miR-29 en las células B y como regulador de la señalización de CD40.
Recientemente, en un intento de identificar los objetivos a nivel mundial utilizando la proteómica cuantitativa - SILAC enfoque, VDAC1 y VDAC2 fueron identificados como objetivos de miR-29a en células HEK293T .
Referencias
Otras lecturas
- Zhang X, Zhao X, Fiskus W, Lin J, Lwin T, Rao R, Zhang Y, Chan JC, Fu K, Márquez VE, Chen-Kiang S, Moscinski LC, Seto E, Dalton WS, Wright KL, Sotomayor E, Bhalla K, Tao J (octubre de 2012). "Silenciamiento coordinado de miR-29 mediado por MYC por HDAC3 y EZH2 como diana terapéutica de modificación de histonas en linfomas agresivos de células B" . Cancer Cell . 22 (4): 506–23. doi : 10.1016 / j.ccr.2012.09.003 . PMC 3973134 . PMID 23079660 .
enlaces externos