ARN nucleolar pequeño U3 - Small nucleolar RNA U3

U3
Estructura secundaria del metazoo U3.png
Conservación de la secuencia y estructura secundaria del ARN U3 del metazoo
Identificadores
Símbolo U3
Alt. Simbolos RNU3P2,
Rfam RF00012
Gen NCBI 26844
HGNC 10176
OMIM 180710
Otros datos
Tipo de ARN snoRNA
Dominio (s) Eucariota ;
Estructuras PDB PDBe

El ARNsno U3 es un ARN no codificante que se encuentra predominantemente en el nucleolo . U3 tiene motivos de caja C / D que técnicamente lo hacen miembro de la clase de snoRNA de caja C / D ; sin embargo, a diferencia de otros ARNsno de caja C / D, no se ha demostrado que dirija la metilación 2'- O - de otros ARN. Más bien, se cree que U3 guía la escisión específica del sitio del ARN ribosómico (ARNr) durante el procesamiento del prerARN.

El elemento de caja C / D es un subconjunto de los seis elementos de secuencia corta que se encuentran en todos los snoRNA de U3, a saber, las cajas A, A ', B, C, C' y D. La estructura secundaria de snoRNA de U3 se caracteriza por un pequeño 5 ' dominio (con casillas A y A '), y un dominio 3' más grande (con casillas B, C, C 'y D), estando los dos dominios enlazados por una bisagra monocatenaria. Las cajas B y C forman el motivo B / C, que parece ser exclusivo de los snoRNA de U3, y las cajas C 'y D forman el motivo C' / D. Este último es funcionalmente similar a los motivos C / D que se encuentran en otros snoRNA. El dominio 5 'y la región bisagra actúan como un dominio de unión a pre-rRNA. El dominio 3 'tiene sitios de unión a proteínas conservados. Tanto los motivos de la caja B / C como de la caja C '/ D son suficientes para la retención nuclear del ARNsno U3. El motivo de la caja C '/ D también es necesario para la localización nucleolar, la estabilidad y la hipermetilación del snoRNA U3. Tanto los motivos de caja B / C como C '/ D están involucrados en interacciones proteicas específicas y son necesarios para las funciones de procesamiento del ARNr del ARNsno U3.

Modelos de estructura secundaria específicos de la especie

Está disponible la estructura secundaria de S. cerevisiae determinada por mapeo químico del ARN U3A en un snoRNP purificado. Un humano modelo de estructura también se ha propuesto. Como la levadura y el ser humano, el protista protozoario Entamoeba histolytica: un eucariota primitivo adoptó la misma estructura secundaria conservada del snoRNA U3. Se han propuesto cuatro estructuras de consenso específicas para metazoos , hongos , plantas y eucariotas basales.

Ver también

Referencias

enlaces externos