Proteína G - Protein G
La proteína G es una proteína de unión a inmunoglobulina expresada en bacterias estreptocócicas del grupo C y G de forma muy similar a la proteína A, pero con diferentes especificidades de unión. Es una proteína de superficie celular de 65 kDa (proteína G G148) y de 58 kDa (proteína G C40) que ha encontrado aplicación en la purificación de anticuerpos a través de su unión a la región Fab y Fc . La molécula nativa también se une a la albúmina , pero debido a que la albúmina sérica es un contaminante importante de las fuentes de anticuerpos, el sitio de unión a la albúmina se ha eliminado de las formas recombinantes de proteína G. Esta proteína G recombinante, ya sea marcada con un fluoróforo o con una hebra de ADN monocatenaria , se usó como reemplazo de anticuerpos secundarios en imágenes de inmunofluorescencia y superresolución.
Otras proteínas de unión a anticuerpos
Además de la proteína G, otras proteínas bacterianas que se unen a inmunoglobulinas, como la proteína A , la proteína A / G y la proteína L, se utilizan comúnmente para purificar, inmovilizar o detectar inmunoglobulinas. Cada una de estas proteínas de unión a inmunoglobulinas tiene un perfil de unión de anticuerpos diferente en términos de la porción del anticuerpo que se reconoce y la especie y tipo de anticuerpos que se unirá.
Plegamiento de la proteína G, dominio B1
Una simulación ab initio del dominio de la proteína G B1 demuestra que, como sugirieron los resultados anteriores, esta proteína inicia el plegamiento a través de un evento de nucleación en los residuos del núcleo hidrófobo seguido de pequeños ajustes. Los eventos de plegado son los siguientes:
- Se forma una horquilla β , estabilizada por los residuos W43, Y45 y F52.
- Los contactos de residuos entre el residuo F30, en una hélice α , y la horquilla β se fortalecen.
- Se produce la nucleación de la hoja β a partir de los residuos L5 y F52.
- El último residuo de nucleación, Y3, ayuda a formar la parte central de la hoja β dando como resultado una proteína globular .
El dominio de la proteína G B1 (también conocido como GB1) se usa a menudo como parte de una proteína de fusión para mantener otros dominios en solución durante los experimentos en solución (por ejemplo, NMR ). Muchos dominios previamente insolubles se han vuelto solubles con la fusión del dominio GB1. El dominio tiene 56 residuos (aproximadamente 8 kDa) de longitud. En los geles SDS-PAGE, el dominio GB1 se ejecuta a aproximadamente 13,5 kDa a pesar de tener solo 8 kDa.