Polimerasa - Polymerase
Una polimerasa es una enzima ( EC 2.7.7.6/7/19/48/49) que sintetiza largas cadenas de polímeros o ácidos nucleicos . La ADN polimerasa y la ARN polimerasa se utilizan para ensamblar moléculas de ADN y ARN , respectivamente, copiando una hebra de plantilla de ADN usando interacciones de emparejamiento de bases o ARN mediante replicación de media escalera.
Un ADN polimerasa a partir de la termófila bacteria , Thermus aquaticus ( Taq ) ( PDB 1BGX , EC 2.7.7.7) se utiliza en la reacción en cadena de la polimerasa , una técnica importante de la biología molecular .
Una polimerasa puede depender de la plantilla o ser independiente de la plantilla. La poli-A-polimerasa es un ejemplo de polimerasa independiente de la plantilla. También se sabe que la desoxinucleotidil transferasa terminal tiene actividades independientes del molde y dependientes del molde.
Tipos
Por función
ADN polimerasa | ARN polimerasa | |
---|---|---|
La plantilla es ADN | ADN polimerasa dependiente de ADN o ADN polimerasas comunes |
ARN polimerasa dependiente de ADN o ARN polimerasas comunes |
La plantilla es ARN | ADN polimerasa dependiente de ARN o transcriptasa inversa |
ARN polimerasa dependiente de ARN o RdRp o ARN-replicasa |
-
ADN polimerasa ( ADN polimerasa dirigida por ADN, DdDP)
- Familia A: ADN polimerasa I ; Pol γ , θ , ν
- Familia B: ADN polimerasa II ; Pol α , δ , ε , ζ
- Familia C: ADN polimerasa III holoenzima
- Familia X: Pol β , λ , μ
- Terminal desoxinucleotidil transferasa (TDT), que da diversidad a las cadenas pesadas de anticuerpos.
- Familia Y: ADN polimerasa IV (DinB) y ADN polimerasa V (UmuD'2C) - polimerasas reparadoras de SOS ; Pol η , ι , κ
- Transcriptasa inversa (RT; ADN polimerasa dirigida por ARN; RdDP)
- ARN polimerasa dirigida por ADN (DdRP, RNAP)
- Multi-subunidad (msDdRP): ARN polimerasa I , ARN polimerasa II , ARN polimerasa III
- Subunidad única (ssDdRP): polimerasa de ARN T7 , POLRMT
- Primase , PrimPol
-
RNA replicasa (RNA polimerasa dirigida por RNA, RdRP)
- Viral (subunidad única)
- Celular eucariota (cRdRP; subunidad dual)
- Alargamiento de ARN sin plantilla
- Poliadenilación : PAP , PNPase
Por estructura
Las polimerasas generalmente se dividen en dos superfamilias, el pliegue de la "mano derecha" ( InterPro : IPR043502 ) y el pliegue de " barril beta doble psi " (a menudo simplemente "doble barril"). El primero se observa en casi todas las ADN polimerasas y casi todas las polimerasas virales de subunidad única; están marcados por un dominio de "palma" conservado. Este último se observa en todas las ARN polimerasas de múltiples subunidades, en cRdRP y en las ADN polimerasas de la "familia D" que se encuentran en las arqueas. La familia "X" representada por la ADN polimerasa beta tiene solo una forma vaga de "palma" y, a veces, se considera una superfamilia diferente ( InterPro : IPR043519 ).
Las primas generalmente no entran en ninguna categoría. Las primasas bacterianas suelen tener el dominio Toprim y están relacionadas con las topoisomerasas y el centelleo helicasa mitocondrial . Archae y eucariotas primasas forman una familia AEP no relacionada, posiblemente relacionada con la palma polimerasa. Sin embargo, ambas familias se asocian al mismo conjunto de helicasas.
Ver también
- Dogma central de la biología molecular
- Exonucleasa
- Ligase
- Nucleasa
- PCR
- PARP
- Reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa
- Ligasa de ARN (ATP)
Referencias
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