Editor de moléculas - Molecule editor
Un editor de moléculas es un programa de computadora para crear y modificar representaciones de estructuras químicas .
Editores molécula puede manipular representaciones de estructuras químicas, ya sea en un simulado espacio de dos dimensiones o el espacio tridimensional , a través de 2D de gráficos de ordenador o de gráficos de ordenador en 3D , respectivamente. Los resultados bidimensionales se utilizan como ilustraciones o para consultar bases de datos de productos químicos . La salida tridimensional se utiliza para construir modelos moleculares, generalmente como parte de paquetes de software de modelado molecular .
Los editores moleculares de bases de datos como Leatherface, RECAP y Molecule Slicer permiten que un gran número de moléculas se modifiquen automáticamente de acuerdo con reglas como "desprotonar ácidos carboxílicos" o "romper enlaces exocíclicos" que puede especificar un usuario.
Los editores de moléculas suelen admitir la lectura y escritura de al menos un formato de archivo o notación de línea . Los ejemplos de cada uno incluyen Molfile y la especificación de entrada de línea de entrada molecular simplificada (SMILES), respectivamente.
Los archivos generados por editores de moléculas se pueden mostrar mediante herramientas de gráficos moleculares .
Programas independientes
| Programa | Desarrollador (es) | Licencia | Plataformas | Información | |
|---|---|---|---|---|---|
| ACD / ChemSketch | ACD / Labs | Propiedad | Ventanas | Una interfaz de dibujo químicamente inteligente que permite dibujar casi cualquier estructura química, incluidos los orgánicos, organometálicos, polímeros y estructuras Markush. versión freeware disponible | |
| Amira (software) |
Visage Imaging Zuse Institute de Berlín |
Propiedad | Windows, macOS , Linux | Versión de prueba de 14 días disponible | |
| Diseñador Ascalaph | Molécula ágil | GNU GPL | Linux, Windows | freeware | |
| Avogadro | Equipo del proyecto Avogadro | GNU GPL | Linux, macOS, Windows | Visualizador, editor de moléculas 3D | |
| BALLView | Equipo de proyecto BALL | GNU GPL - LGPL | Linux, macOS, Windows | visor, editor, herramienta de simulación | |
| Bioclipse | Desarrolladores Bioclipse | EPL | multiplataforma | Basado en Java , Eclipse Rich Client Platform (RCP) | |
| ChemDraw | PerkinElmer | Propiedad | macOS, Windows | Editar estructuras y reacciones químicas | |
| Deneb | AtelGraphics | Propiedad | Linux, Windows | Versión de prueba disponible; Escritorio con interfaz gráfica de usuario fácil de usar para paquetes SIESTA, VASP, QE, etc. | |
| ChemWindow | Wiley | Propiedad | Ventanas | disponible como parte del entorno de software KnowItAll; Freeware para investigación académica y docencia | |
| Gabedit | Abdulrahman Allouche | BSD | Linux, macOS, Windows | Visualizador, editor de moléculas 3D | |
| JChemPaint | GNU LGPL | multiplataforma | Editor de fórmulas estructurales 2D escrito en Java | ||
| Entorno operativo molecular (MOE) | Grupo de Computación Química | Propiedad | Windows, Linux, Mac; Lenguaje de programación SVL | Plataforma para aplicaciones de modelado molecular / descubrimiento de fármacos, con dibujo y edición molecular en 3D, representación en 2D y conversión de 2D a 3D. | |
| SANSÓN | Inria | Propiedad | Windows, Linux, macOS | Plataforma de software para nanociencia computacional integrada. Personalizado con SAMSON Elements (módulos para SAMSON) | |
| espartano | Wavefunction, Inc. | Propiedad | Linux, macOS, Windows | ||
| XDrawChem | GNU GPL | Linux, macOS, Windows | basado en OpenBabel |
Applets de Java
| Applet | Desarrollador (es) | Licencia | Información |
|---|---|---|---|
| JChemPaint | GNU LGPL | Subprogramas del editor y del visor | |
| Editor de moléculas JME | Peter Ertl | Propiedad | software gratuito disponible en Molinspiration ; Freeware para uso no comercial |
Editores insertables de JavaScript
| Programa | Desarrollador | Navegador de escritorio IE6-7-8 | Navegador de escritorio otro | iPad | iPhone | Androide | Telefono windows | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Programa Kekulé | Laboratorio de Kekule.js | sí | sí | Desconocido | Desconocido | Desconocido | Desconocido | Publicado bajo la licencia MIT |