El SuperDraft de la MLS 2016 fue el decimoséptimo SuperDraft realizado por la Major League Soccer . El SuperDraft se lleva a cabo cada año junto con la convención anual de la Asociación Nacional de Entrenadores de Fútbol de América . La convención de 2016 se llevó a cabo en Baltimore , Maryland . Las dos primeras rondas del SuperDraft 2016 se llevaron a cabo el 14 de enero de 2016. Las rondas tres y cuatro se llevaron a cabo mediante teleconferencia el 19 de enero de 2016.
El 6 de junio de 2013, Vancouver Whitecaps adquirió una selección condicional en el SuperDraft 2016 y una selección de segunda ronda en el SuperDraft 2015 de DC United a cambio del defensor Alain Rochat . No se cumplieron las condiciones para activar la selección de SuperDraft 2016.
El 6 de enero de 2015, Colorado Rapids recibió al portero Zac MacMath en préstamo para la temporada 2015 de Philadelphia Union . El acuerdo de préstamo incluía una disposición de que Filadelfia adquiriría una selección de primera ronda en el SuperDraft 2016 de Colorado en caso de que Colorado ejecutara una transferencia permanente para MacMath al final de la temporada 2015. El 5 de noviembre de 2015, Colorado anunció que no ejercería la opción de transferencia en MacMath.
