La Liga Americana de Fútbol Sala de 2006 fue la segunda temporada general de la liga. Los campeones de la liga fueron los Canton Legends , que derrotaron a los Rome Renegades en el American Bowl II.
El verde indica una plaza asegurada en los playoffs
Morado indica campeón de división
El gris indica el mejor récord de la liga
Durante la temporada regular, todos los equipos jugaron dentro de su conferencia.
* = Completado para juegos, debido a que Syracuse se plegó durante la temporada. Los tres de estos equipos eran equipos de aficionados al aire libre en la Liga de Fútbol de América del Norte .
** = Jugó el resto de los juegos de gira de Ghostriders debido a que el equipo se retiró durante la temporada.