El equipo comenzó la temporada 2004 en 3-0 con victorias aplastantes sobre el estado de Utah , Mississippi y Western Carolina . El mariscal de campo titular de The Tide, Brodie Croyle, se lesionó durante el juego de Western Carolina y perdió durante la temporada. Sin él, el equipo luchó por encontrar una ofensiva consistente contra los oponentes de la SEC, Arkansas y Carolina del Sur . El equipo se recuperó para tener múltiples victorias por reventones en tres de los siguientes cuatro juegos, solo perdiendo ante su rival Tennessee . La temporada terminó con una racha de tres juegos, perdiendo ante sus rivales LSU y Auburn , y también perdiendo en el Music City Bowl ante Minnesota . Esta temporada también marca la primera vez desde 1958 en la que Alabama estuvo ausente del top 25 de la encuesta de AP cada semana de la temporada.
Clima del juego: 84 °, parcialmente nublado, vientos del NNE a 9 mph
Árbitro: Rocky Goode
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Alabama abrió la temporada 2004 al derrotar a los Utah State Aggies 48-17. Brian Bostick anotó los primeros puntos de Alabama del juego con su gol de campo de 28 yardas . En la posesión de Aggies que siguió, Roman Harper interceptó un Travis Cox y lo devolvió a la yarda 21 del estado de Utah. Dos jugadas después, Brodie Croyle lanzó un pase de touchdown de 19 yardas a Clint Johnston para darle a Crimson Tide una ventaja de 10-0. Los Aggies respondieron más tarde en el primero con un pase de touchdown de Cox de 35 yardas a Kevin Robinson para reducir el marcador a 10–7. En el segundo cuarto, Kenneth Darby anotó para Alabama en una carrera de 29 yardas y Ben Chaet conectó en un gol de campo de 44 yardas para Utah State para hacer el marcador de medio tiempo 17-10.
En la tercera jugada de la segunda mitad, Simeon Castille interceptó un pase de Cox y lo devolvió 31 yardas para el primer touchdown de su carrera. Después de que la defensa de Alabama forzó un despeje en la siguiente serie de Aggies, Croyle lanzó un touchdown de 57 yardas a Keith Brown en la primera jugada ofensiva de Crimson Tide de la segunda mitad para darles una ventaja de 31-10. Después de que un gol de campo de Bostick de 32 yardas extendiera la ventaja de Alabama a 34-10, los Aggies respondieron con sus últimos puntos del juego en un pase de touchdown de Cox de 21 yardas a Chris Forbes. The Crimson Tide luego cerró el juego con un par de touchdowns en el último cuarto. El primero llegó con una carrera de Tim Castille de una yarda y el segundo con una carrera de Ray Hudson de siete yardas en la victoria de Alabama 48-17.
Clima del juego: 85 °, parcialmente nublado, vientos del ENE a 3 mph
Árbitro: Matt Austin
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Alabama abrió el juego de conferencias al derrotar a su rival de mucho tiempo , las Ole Miss Rebels 28–7. Después de un primero sin anotaciones, Crimson Tide tomó una ventaja de 14-0 en el medio tiempo después de anotar un par de touchdowns en el segundo cuarto. Tim Castille anotó primero en una carrera de una yarda y Tyrone Prothro anotó segundo en un pase de touchdown de Brodie Croyle de 15 yardas . Alabama extendió su ventaja a 21-0 en el tercer cuarto cuando Ray Hudson anotó su primero de dos touchdowns en un pase de Croyle de 13 yardas. Después de que los rebeldes anotaron sus únicos puntos del juego en una recepción de touchdown de Eric Rice de seis yardas de Ethan Flatt, Alabama respondió en la siguiente serie con un touchdown de Hudson de 46 yardas para hacer el marcador final 28–7. En el juego, Hudson corrió para 116 yardas, y DJ Hall y Keith Brown se convirtieron en los primeros receptores de primer año en abrir para Alabama desde Ozzie Newsome en 1974 .
Clima del juego: 63 °, lluvia ligera, vientos del E a 5 mph
Árbitro: Steve Landis
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En la edición de 2004 del Iron Bowl , Crimson Tide tomó una ventaja de 6-0 en el medio tiempo sobre el favorito Auburn , pero finalmente cayó 21-13 ante los Tigres . Alabama tomó una ventaja de 6-0 en el medio tiempo con goles de campo de 42 y 22 yardas de Brian Bostick. Auburn respondió en la segunda mitad con 21 puntos consecutivos para tomar una ventaja de 21–6. Los touchdowns fueron anotados por Cadillac Williams en una carrera de cinco yardas, en un pase de Jason Campbell de 32 yardas a Courtney Taylor y en una carrera de Ronnie Brown de dos yardas . Alabama anotó su único touchdown al final del cuarto en un pase de touchdown de Spencer Pennington de 18 yardas a DJ Hall para hacer el marcador final 21-13 después de una patada onside fallida .
Clima del juego: 60 °, nublado, vientos SO a 15 mph
Árbitro: Jack Cramer
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Después de terminar la temporada regular con un récord general de 6-5, Crimson Tide aceptó una invitación para jugar en el Music City Bowl el 4 de diciembre. Su aparición fue la segunda de Alabama en el juego, marcó el primer encuentro de todos los tiempos contra los Minnesota Golden Gophers en el campo de juego y un regreso a la postemporada para Crimson Tide luego de una prohibición de dos años impuesta por la NCAA. Liderados por los corredores Marion Barber III y Laurence Maroney, que corrieron cada uno para más de 100 yardas, Minnesota derrotó a Alabama 20-16.
El Crimson Tide anotó primero cuando Spencer Pennington lanzó un pase de touchdown de dos yardas a Le'Ron McClain para una ventaja de 7-0 en Alabama. Minnesota empató el juego más tarde en el primero con un touchdown defensivo. La puntuación ocurrió después de que Anthony Montgomery forzara un balón suelto de Pennington que Keith Lipka recuperó en la zona de anotación. Los Gophers tomaron una ventaja de 17–7 en el segundo cuarto después de una carrera de touchdown de Barber de cinco yardas y un gol de campo de Rhys Lloyd de 27 yardas . El Crimson Tide respondió con una carrera de touchdown de McClain de una yarda para reducir la ventaja de Minnesota a 17-14 en el medio tiempo. La segunda mitad estuvo dominada por ambas defensas con Minnesota solo logrando anotar en un gol de campo de Lloyd de 24 yardas en el tercero y Alabama solo anotó en un profundo en el cuarto para hacer el marcador final 20-16.